Биогенные элементы, усваиваемые растительностью, выводятся из круговорота, что снижает степень опасности возникновения большой биомассы (цветения) фитопланктона и особенно нежелательного цветения синезеленых простейших водорослей. Таким образом, высшая водная растительность способствует самоочищению водоемов.
Произрастание макрофитов зависит от целого ряда факторов: течений, колебания уреза воды, температуры, характера донных отложений, питательных веществ и, конечно, от световых условий водоема. Последний фактор чаще всего .характеризуется прозрачностью воды. Например, И. М. Распопов считает, что макрофиты дают представление о литоральной зоне озер, т. е. нижняя глубина произрастания макрофитов соответствует нижней границе литорали. Площадь литорали меняется в зависимости от гидрофизических параметров, в особенности от прозрачности воды. К сожалению, многие авторы показав существенную роль света (прозрачности воды), не дают конкретных связей и даже значений прозрачности воды в местах Обитания различных видов высшей водной растительности.
Имеющиеся материалы свидетельствуют о том, что рост прозрачности воды увеличивает глубину обитания водорослей, но другие факторы могут, вносить свои коррективы в изменение площади произрастания макрофитов в озере.