Диатомовые-олигогалобы
Водоросли составляют 60 % общего числа таксонов. По 20 % составляют северо-альпийские и бореальные виды. К северо-альпийским относятся такие виды, как Aulacoseira distans var. distans, Cyclotella vorticosa, C. planctonica, ряд видов родов Achnanthes, Caloneis и Fragilaria. К этой же группе Н. Н. Давыдова (1985) относит и ряд массовых видов, например Aulacoseira islandica, A. italica subsp. subarctica. Среди бореальных видов такие массовые формы, как Tabellaria fenestrata, Cyclotella ocellata, C. quadrijuncta и др. Специфические теплолюбивые виды полностью отсутствуют в составе ладожских диатомей. Диатомовая флора Ладожского озера носит сугубо пресноводный характер (Давыдова, 1985).
Наиболее многочисленны пресноводные диатомовые-олигогалобы, составляющие 98 % общего числа таксонов. Среди них преобладают индифференты, к которым относится большинство массовых видов. Среди галофобов наиболее массовые Cyclotella vorticosa, Tabellaria fenestrata, T.flocculosa, среди галлофилов — Fragilaria crotonensis, Diatoma elongatum, Stephanodiscus binderanus, Cyclotella kuetzingiana. По отношению к рН среды, которая в Ладожском озере близка нейтральной, большинство ладожских диатомей относятся к алкалифилам или алкалибионтам. Доминирующий вид планктона Aulacoseira islandica относится к индифферентам. Ацидофилы и ацидобионты немногочисленны. Наиболее массовые из них Tabellaria fenestrata и T.flocculosa.