В сезонной динамике ФП Балтийского моря различают четыре биологических сезона. Биологическая зима (примерно с 15 декабря до 15 марта) характеризуется весьма слабым развитием ФП. Биологическая весна (15 марта — 15 июня) — период бурного развития ФП; доминируют диатомовые и перидинеи; максимум развития приходится на вторую половину марта. Биологическое лето (15 июня —15 сентября) характеризуется сменой весеннего комплекса холодноводных видов диатомовых на летний комплекс, среди которых доминируют синезеленые и диатомовые; массовое развитие синезеленых занимает период с июля по сентябрь с максимумом в июле—августе, температура воды 15 °С. Начало биологической осени — вторая половина сентября — начало октября; в этот период наблюдается ослабление развития синезеленых и вторая, хотя и менее интенсивная, вспышка диатомовых.
Эти данные интересно сравнить с сезонной динамикой озерного ФП тех же широт. В олиготрофном оз. Пааярви (Финляндия) бурное развитие ФП приходится на период со второй половины мая по первую декаду октября, когда поверхность озера свободна ото льда. В видовой изменчивости эвтрофного оз. Лавоярви (Финляндия) наблюдаются две вспышки диатомовых (конец мая и середина октября), две вспышки криптофитовых (первая половина мая и начало сентября) и одна вспышка синезеленых (конец июля).