Азот и фосфор в воде
На органическую составляющую приходится 70—80 % и более от общего содержания фосфора. Концентрация общего азота за рассматриваемый период наблюдений изменялась от 500 до 730 мкг N/л. Основную часть составляет органический азот, на долю нитратного приходится 20—30 % (85—220 мкг/л), содержание аммонийного азота, по наблюдениям 2004 г., не превышает 44 мкг N/л, а в отдельные сроки он практически не обнаруживается. Природные условия Ладожского озера и рек его бассейна в значительной степени определяют особенности развития в них фитопланктона.
История изучения диатомовых водорослей планктона Ладожского озера и рек его бассейна. Первые небольшие списки диатомовых водорослей, встреченных преимущественно в грунтах и только отчасти в планктоне и обрастаниях Ладожского озера, относятся к концу XIX в. В монографии Клеве по диатомовым водорослям Финляндии приводится список из 65 форм, среди которых преобладали планктонные. В начале XX в., в 1902—1903 гг. и 1911—1914 гг., в связи с изучением р. Невы и Ладожского озера как источников водоснабжения Санкт-Петербурга, были предприняты первые серьезные исследования планктона Ладоги. Результаты регулярных исследований фитопланктона обобщены в фундаментальной монографии Евгения Николаевича Балахонцева «Ботанико-биологические исследования Ладожского озера» (1909).
Материалом для монографии послужили данные о фитопланктоне озера, собранные автором в 1905—1906 гг., преимущественно в южном районе Ладоги, в Шлиссельбургской губе (ныне губа Петрокрепость), Волховской и Свирской губах, в западном районе у острова Коневиц, в глубоководной части озера у острова Валаам и в устье рек Волхов, Свирь, Морье.